表观调控

ATAC-Seq

利用Tn5转座酶捕获开放染色质区域,比较不同状态下的染色质可及性。

技术原理

ATAC-Seq通过转座酶对可接近的染色质进行切割和接头插入,结合测序建立开放染色质图谱。适合比较细胞状态、实验处理或组织之间的可及性变化,并与RNA-Seq、ChIP-Seq等数据结合研究基因调控。

应用方向

  • 比较处理组与对照组的开放染色质区域
  • 筛选候选调控元件并开展motif分析
  • 关联表达变化与染色质状态,形成调控假设

方法特点

  • 实验流程相对精简,适合低起始量项目评估
  • 从全基因组范围研究染色质可及性
  • 可与转录组及蛋白-DNA互作数据联合分析

服务流程

  1. 01

    细胞或细胞核制备与质量评估

  2. 02

    Tn5转座反应并插入测序接头

  3. 03

    文库扩增、质控与测序

  4. 04

    开放区域识别、差异分析与调控注释

流程为技术路线概览,实验与分析细节根据样本条件和研究目标确定。

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