技术原理
CLIP-Seq将交联免疫沉淀与高通量测序结合，捕获RNA与RNA结合蛋白的互作区域。用于研究RBP的结合分布、序列偏好，以及剪接、RNA稳定性和其他转录后调控问题。
应用方向
- 识别RBP在RNA上的候选结合区域
- 研究RNA结合区域的motif与序列偏好
- 分析剪接因子结合与转录后调控关系
方法特点
- 交联策略支持研究细胞内的RNA-蛋白互作
- 相较常规富集筛选，更侧重结合区域研究
- 需按目标RBP选择交联、抗体和建库路线
服务流程
- 01
确定RBP、抗体与交联方案
- 02
交联并免疫富集RNA-蛋白复合物
- 03
结合RNA片段回收、建库与测序
- 04
结合区域识别、motif与转录本注释
流程为技术路线概览，实验与分析细节根据样本条件和研究目标确定。